近似-指向图的学习揭示出肿瘤相关近似抗原

本期编译精选。

摘要

膜蛋白的空间组织是细胞表面生物学1,2的一个未充分探索的维度。空间相接会形成细胞功能和治疗可瞄准性2,3,然而识别肿瘤相关抗原(TAAs)的努力主要集中于表达单4. 在这里，我们开发了一个工业化的地表蛋白相近映射工作流程，以在细胞膜的微环境内询问TAA。利用这个工作流程，我们绘制了248个近距离图，覆盖了12个受体ty基活酶和28个肿瘤细胞系统。由此产生的地图集使MetaMap得以开发，这是一个基于相关性的分析框架，它定义了空间蛋白质群落并推断了非目标蛋白质之间保护了近距离关系，并确立了肿瘤相关近距离抗原(TAPA)的概念，这是一类由疾病特定空间相近于TAAA而不是单独表达来定义的共目标。将这些近亲关系纳入多式联运优先框架，我们确定并验证了EGFR-CDCP1是TAA-TAPA的一对，可以加强肿瘤细胞在治疗方式上的杀伤力。这项工作共同推动了与疾病相联的膜相接，作为精确多特异性疗法设计的指导原则。

主要

细胞表面是细胞膜蛋白组织调节多种生物过程的动态地貌，包括免疫突触形成，上位神经相接组织和受体介质信号1,5. 膜蛋白相接是免疫受体6 细胞通基受体7 受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受体通基受

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（编译自 Nature；原文